Segue dica de programas para ajudar na hora de fazer aquelas animações, são fundamentais para incrementar aquele projeto ou aparesentação.
Pencil: http://www.les-stooges.org/pascal/pencil/index.php
Synfig: http://www.synfig.com/
KToon: http://ktoon.toonka.com/
E para 3d é o Blender: http://www.blender.org/